论文查重技术在知识产权保护中的应用方法主要包括：1.检测抄袭：通过对已有文献进行比对，检测出论文中的相似内容，从而防止学术不端行为的发生。2.保护知识产权：通过查重技术，可以及时发现侵权行为，保护研究成果的合法权益。3.提升学术水平：通过查重技术，可以引导研究者注重原创性，提高学术质量。4.提供参考：通过查重技术，可以为研究者提供相关领域的参考文献，帮助其深入研究。

此外，还可以通过论文查重技术来发现学术界的研究热点和趋势，为学术交流和科研决策提供参考。同时，利用论文查重技术可以避免重复投稿，提高学术资源的利用效率。在知识产权保护中，论文查重技术扮演着重要的角色，对于保护学术界的创新成果和知识产权具有积极的促进作用。